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PFA軟管的潔凈度比PVC軟管更高。
PFA軟管由全氟烷氧基樹脂制成，具有、不吸附雜質的特點，在高溫或化學環境下幾乎無小分子析出。其符合食品用、醫藥級以及半導體行業的純潔凈要求，例如半導體級PFA波紋管的純度標準需滿足SEMIF57規范，金屬離子含量控制在ppb級，采用進口原料生產的管材，鈉、鉀等關鍵雜質含量小于0.1ppb。此外，PFA管內壁經過等離子體拋光后，粗糙度Ra值可達0.05μm，能減少顆粒殘留。
而PVC軟管在使用過程中可能釋放微量塑化劑和氯離子，長期使用會影響超純水的TOC（總有機碳）和電阻率。其離子析出量相對較高，約為>50ppb，且表面粗糙度也較大，不利于保持高潔凈度。因此，PVC軟管一般用于對水質要求不嚴格的普通純水系統等場景，不適用于對潔凈度要求的領域。
